為提昇校務管理能力，落實以實證為本之校務決策，提升辦學品質，強化校務經營效率與效能，以利學校之永續發展，臺北醫學大學於104學年度起，正式在秘書處下設立校務研究辦公室（Institutional Research Office）。本辦公室首要工作為建置校務研究資料庫，並利用資料庫內涵進行數據分析，完整掌握體系內的資訊，並將資料做有效的鏈結運用，透過定期之分析報告，提供校務資訊分析之回饋，建立行政與教學之數據為本、承諾績效責任的決策模式。

此外，本校亦獲得教育之補助支持，允以執行三年期之＂大學提升校務專業管理能力＂計畫，在此基礎下已將校務研究之工作落實到各單位，並建立校務研究之氛圍，讓各單位了解校務研究之重要性，提升同仁校務研究之素養。

本校校務研究資料庫已建置完成，包含校學研究資料及臨床資料，本校為醫學大學且有三家附屬醫院，在資料蒐集面上和非醫學大學很不一樣，本校資料庫除了納入學校面的資料外，還有醫院的臨床資料，這是校務研究資料庫的一大特色。

本校期望透過校務研究之推動與落實，並藉由蒐集教學、研究、學生學習及行政支援等校務資料，結合自我評鑑結果，適時提供適量具事實依據之分析研究，以為校務發展決策及成效評估之參考依據，能協助本校制訂有效的校務改進與教學之發展策略，進而提升本校校務專業管理能力與辦學校能，達成永續發展之目標。